马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析

摘要：

为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等.结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃薯11条染色体上.扩展蛋白氨基酸长度为194～488 aa,编码蛋白质具有保守的结构域,蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外.基因结构分析表明,马铃薯扩展蛋白家族有23个基因(69.7％)含有2～3个内含子.基因表达分析发现,该家族基因在马铃薯根、茎、匍匐茎、果实及块茎发育过程中表达丰度较高,并且其表达受到高温、盐、激素及病害等逆境的调控.

关键词：马铃薯、扩展蛋白、生物信息学、基因家族

所属期刊栏目：32

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：河南省农业科学院自主创新项目2016ZZ20

在线出版日期：2018-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：37-44