甘蓝枯萎病抗性基因 FOC1序列分析及抗性相关变异位点分析

摘要：

旨在发掘甘蓝抗枯萎病基因 FOC1中与抗性相关的特异性单核苷酸多态性（SNP），为进一步开发 FOC1特异分子标记提供理论依据。在对11份甘蓝自交系材料枯萎病抗病表型鉴定基础上，通过基因测序，对每份材料中FOC1等位基因及相应的氨基酸序列变异进行分析。结果表明，FOC1等位基因序列之间共存在92处 SNP 变异和2处 Indel 变异，其中包含 C381 A ／G 等18个在抗、感材料中表现出特异性差异的 SNPs。此18个特异的 SNP 中转换型比率为86．11％、颠换型比率为13．89％，4种碱基变异率以 T ／C、G ／A 最高，分别占47．22％和38．89％，而 C ／G 和 A ／C变异率共占13．89％。本研究也发现抗、感材料中存在4个特异的 SNP，可造成3个氨基酸的变化。

关键词：甘蓝、抗枯萎病、特异 SNP、序列分析

所属期刊栏目：31

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：“十二五”国家科技支撑计划项目2012BAD02B01；2014BAD01 B08；北京市科委项目Z141105002314020

在线出版日期：2016-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1-10