鸟巢蕨EST-SSR标记的开发与应用
为加速分子标记在鸟巢蕨研究中的应用,利用鸟巢蕨EST序列开展了EST-SSR标记的开发和应用研究.利用MISA软件对鸟巢蕨EST序列进行SSR位点查找,分析EST-SSR的总体特征,并利用Primer 3.0软件设计40对引物,选用10份蕨类材料检测引物的多态性.从42 907条鸟巢蕨EST序列中检测到6 067个SSR位点,其出现频率为1/6.62 kb,包括106种重复基元.在鸟巢蕨EST-SSR中,二核苷酸重复(2 873个,47.35％)是最主要的类型,其次是三核苷酸(1 107个,18.25％)和单核苷酸(972个,16.02％).出现最多的重复基元是AG/TC(1 371个,22.60％),其次是CA/GT(1 066个,17.57％)和A/T(628个,10.35％).设计合成了40对EST-SSR引物对10份蕨类材料进行PCR扩增,26对引物能扩增出明显条带,其中17对引物扩增出了65条多态性条带,平均每对引物多态性带为3.82条.遗传分析表明,10份蕨类材料之间的遗传相似系数为0.338～0.815,可将供试蕨类材料分为2个类群.从鸟巢蕨EST序列中开发SSR标记是有效和可行的,开发的EST-SSR引物可用于蕨类植物遗传分析研究.
鸟巢蕨、分子标记、EST-SSR
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S682.03(观赏园艺（花卉和观赏树木）)
江苏省农业科技自主创新资金品种创新项目CX132044
2016-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
134-139
