京海黄鸡 MyoG 基因密码子特性分析

摘要：

为了解鸡MyoG基因的密码子特性，以便于为MyoG基因的表达选择合适的外源表达系统，使用在线工具CUSP和CHIPS以及codonW软件对鸡MyoG基因进行分析，并与鸡基因、模式动物基因组和其他动物MyoG基因进行比较。结果表明，MyoG基因偏好于G/C结尾的密码子，CDS序列中，GC含量大于AT含量。 MyoG基因与鸡其他31个基因密码子偏好性相似，均偏好于G/C结尾的密码子。与其他物种基因组密码子偏好性比较结果显示，密码子偏好性与小鼠差异最小，说明小鼠可以作为MyoG基因外源表达的宿主。与其他动物MyoG基因密码子偏好性比较显示，MyoG基因在包括京海黄鸡在内的32个物种中均有较高表达，几乎所有MyoG基因编码区对GC有较强的偏好性。基于RSCU值的聚类和基于CDS区系统发育树结果显示，亲缘关系近的物种之间倾向于拥有相似的密码子偏好性。

关键词：京海黄鸡、MyoG、密码子、偏好性、聚类分析

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：江苏省高校自然科学研究项目12KJB230003；国家肉鸡产业技术体系项目nycytx-42-G1-05；江苏高校优势学科建设工程项目；江苏省动物遗传繁育与分子设计重点实验室项目

在线出版日期：2014-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：71-79