天祝白牦牛APEX-1基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

克隆天祝白牦牛脱嘌呤嘧啶核酸内切酶基因( APEX-1)全长cDNA序列,为研究天祝牦牛高原抗逆性机制提供理论基础。根据已知哺乳动物APEX-1基因cDNA序列同源性,设计引物以及5′和3′特异性引物,运用cDNA末端快速扩增( RACE)技术获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列。扩增获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cD-NA序列为1391 bp(GenBank登录号：KF611690),ORF长957 bp,编码318个氨基酸。氨基酸序列分析显示天祝白牦牛APEX-1基因编码氨基酸序列与大多数哺乳动物相似,但有7个氨基酸突变。同源建模预测,显示天祝白牦牛A-PEX-1蛋白由8个α-螺旋和11个β-折叠片形成一个呈三明治的α/β球蛋白。天祝白牦牛APEX-1基因的成功克隆为进一步研究该基因的功能奠定了基础。

关键词：天祝白牦牛、脱嘌呤嘧啶核酸内切酶、cDNA末端快速扩增、序列分析

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：“十二五”农村领域国家科技计划项目2013AA02505-3

在线出版日期：2014-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：51-55