10.3969/j.issn.1000-7091.2013.03.007
藏山羊瓣胃溶菌酶基因 TGOLyz 的克隆及组织表达分析
基于物种同源性,应用 PCR 和 RT-PCR 技术,克隆得到藏山羊瓣胃溶菌酶基因 cDNA 编码序列,并命名为TGOLyz,应用生物信息学软件对 TGOLyz 基因核苷酸序列及预测的蛋白序列进行了分析,并预测该蛋白的三级结构;应用 qRT-PCR 技术检测了 TGOLyz 在5个组织中的定量表达。结果表明,藏山羊瓣胃溶菌酶基因 TGOLyz cDNA 编码区长444 bp(Accession No.KC558501),编码147个氨基酸,分子量为16.29 kDa,等电点为6.08。同源性对比显示, TGOLyz 与牛胃1(Cow stomach 1)的同源性最高,达95.24%,与牦牛胃(Yak stomach)的同源性最低,仅为67.61%;系统进化树显示,该基因属于 c 型溶菌酶(c-type lysozyme)家族;qRT-PCR 分析表明,TGOLyz 基因在5个组织中均有表达,在瓣胃中表达量最高。这为进一步深入研究 TGOLyz 的抗菌及消化功能的分子调控机制提供了理论基础。
藏山羊、TGOLyz 基因、克隆、定量表达、生物信息学
Q78(基因工程(遗传工程))
国家科技支撑计划项目2012BAD13B06;四川省科技创新产业链示范工程重大项目2011NZ0003
2013-07-26(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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