植物病原细菌 hrp 基因簇比较基因组分析

摘要：

　　hrp基因是植物病原细菌中一类重要的致病基因，一般成簇排列。对14种已完成全基因组测序的植物病原细菌基因组中的hrp基因簇进行了大小、G＋C含量、基因组成的BlastP比较。发现它们的大小在18～24 kb，由22～28个基因组成。欧文氏菌属和假单胞菌属的菌株中G＋C含量较低，拉尔氏菌属和黄单胞菌属菌株的G＋C含量较高。而且，各菌属的基因簇都有其独有的hrp基因，如假单胞菌属是hrpK1、hrpV、hrpA；欧文氏菌属是hrpT、hrpV、hrpA；拉尔氏菌属是hrpZ、hrpX、hrpY、hrpV；黄单胞菌属是hrpE、hrpD6、hpaA。其中，基因hrpA1、hrpA、hrpY和hrpE在假单胞菌属、欧文氏菌属、拉尔氏菌属和黄单胞菌属中均编码Ⅲ型菌毛的基因，可能在寄主和病原物识别中起重要作用。

关键词：植物病原细菌、hrp基因簇、生物信息学分析

分类号：S435.131;Q78(病虫害及其防治)

在线出版日期：2013-08-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：27-31