小麦磷脂酶Dα的基因克隆及其编码序列的生物信息学分析

摘要：

为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析.结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa.序列分析显示,TaPLDα基因编码的氨基酸序列含有N端C2结构域及2个保守的活性中心.预测TaPLDα蛋白是一个亲水性稳定蛋白且定位于细胞质,其二级结构含28.82％的α-螺旋、20.07％的延伸链、6.03％的B-转角和45.07％的不规则卷曲.该蛋白不存在信号肽,无跨膜区.TaPLDα与水稻、玉米和拟南芥的PLDα氨基酸序列之间具有高度的保守性,进化分析显示,小麦PLDα序列与毒麦、水稻和玉米PLD序列亲缘关系密切.

关键词：小麦、磷脂酶Dα、基因克隆、生物信息学

所属期刊栏目：28

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家"863"计划项目2011AA100104;天津市应用基础与前沿技术研究计划项目11JCYBJC09100;国家转基因新品种培育重大专项2009ZX08009-084B

在线出版日期：2013-06-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：117-122