扁吻鱼微卫星分子标记的筛选及特征分析

摘要：

通过磁珠富集法筛选扁吻鱼的微卫星分子标记.利用限制性内切酶Sau3AI对扁吻鱼的基因组DNA进行酶切,并选取片段大小在250 ～750 bp间的片段,利用PCR技术进行全基因组扩增,采用生物素标记的(CA)8探针对微卫星片段进行富集.富集后的片段与T载体连接后利用DH5α大肠杆菌进行转化,然后以Sau3AI为引物对菌落进行PCR扩增,扩增后选片段大小符合条件的菌落挑取至测序板,进行测序.结果表明:PCR筛选共获得563个阳性克隆,其中测序192个阳性克隆后发现有53个微卫星序列；序列分析表明,完美型占67.92％,非完美型为22.64％；混合性标记占9.43％.根据测序结果设计微卫星引物24对,经PCR扩增筛选,琼脂糖凝胶电泳结果显示,其中22对引物可扩增出清晰的条带,其中具有多态性的13对.利用13对多态性引物对扁吻鱼野生群体进行扩增,PCR扩增结果显示,等位基因数为3～6,多态信息含量(PIC)为0.625 3,12个位点处于高度多态水平(PIC ＞0.5).

关键词：扁吻鱼、微卫星、分子标记

所属期刊栏目：27

分类号：S91.03(水产基础科学)

资助基金：国家"863"计划项目2007AA10Z186;水产分子育种共性技术的建立与应用项目200903045

在线出版日期：2013-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：40-45