10.3969/j.issn.1000-7091.2012.z1.003
牙鲆肝脏抗菌肽-2基因序列和表达分析
抗菌肽是鱼类先天免疫的组成部分,发现新的抗菌肽对于动物抗病机理的研究和寻找新药物有重要意义.经过对GenBank数据库中牙鲆EST文库进行同源比对后,筛选得到一个具有完整编码框的抗菌肽cDNA序列,结果再经过RT-PCR进行验证,命名为LEAP-2,对该序列进行注释,获得序列登录号EU586111.该抗菌肽能编码102个氨基酸的多肽,前28个氨基酸组成信号肽.推测编码蛋白质分子量为11 276.9 u,理论等电点(PI)为9.33.其蛋白质序列与另外9种鱼类的同源抗菌肽序列比较发现,同源性介于38.2% ~61.7%.其中57至92位氨基酸为高度保守区,是维持其空间结构的主要区域,其中包含有4个保守的半胱氨酸,可能组成2个二硫键.荧光定量PCR分析显示,LEAP-2基因在肝脏中高表达,在牙鲆仔鱼不同发育时期中也有表达,但是表达水平存在明显差异,特别是在变态中期表达量比较高.
牙鲆、肝抗菌肽2、序列分析、同源建模
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Q785;S917(基因工程(遗传工程))
国家自然科学基金项目31172392;上海市教委科研创新项目12YZ126;上海市自然科学基金12ZR1412900
2013-03-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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