牙鲆肝脏抗菌肽-2基因序列和表达分析

摘要：

抗菌肽是鱼类先天免疫的组成部分,发现新的抗菌肽对于动物抗病机理的研究和寻找新药物有重要意义.经过对GenBank数据库中牙鲆EST文库进行同源比对后,筛选得到一个具有完整编码框的抗菌肽cDNA序列,结果再经过RT-PCR进行验证,命名为LEAP-2,对该序列进行注释,获得序列登录号EU586111.该抗菌肽能编码102个氨基酸的多肽,前28个氨基酸组成信号肽.推测编码蛋白质分子量为11 276.9 u,理论等电点(PI)为9.33.其蛋白质序列与另外9种鱼类的同源抗菌肽序列比较发现,同源性介于38.2％ ～61.7％.其中57至92位氨基酸为高度保守区,是维持其空间结构的主要区域,其中包含有4个保守的半胱氨酸,可能组成2个二硫键.荧光定量PCR分析显示,LEAP-2基因在肝脏中高表达,在牙鲆仔鱼不同发育时期中也有表达,但是表达水平存在明显差异,特别是在变态中期表达量比较高.

关键词：牙鲆、肝抗菌肽2、序列分析、同源建模

所属期刊栏目：27

分类号：Q785;S917(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金项目31172392;上海市教委科研创新项目12YZ126;上海市自然科学基金12ZR1412900

在线出版日期：2013-03-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：12-17