苹果茎尖组织中GA2ox基因的结构特征及蛋白序列的生物信息学分析

摘要：

GA2ox是赤霉素合成代谢的关键酶,以苹果品种富士茎尖为供试材料,应用同源克隆技术克隆GA2ox基因,获得长度为1656 bp的DNA序列和1014 bp cDNA序列.对比分析表明,DNA序列存在3个外显子和2个内含子.GA2ox的开放性阅读框编码337个氨基酸残基,推断其相对分子量为37.6798 kDa,等电点为6.41.蛋白质结构域检索表明,GA2ox属于依赖于2-酮戊二酸的双加氧酶家族成员；氨基酸同源性分析表明,GA2ox与已报道的其他植物的GA2ox氨基酸序列同源性为51％ ～97％；氨基酸聚类分析表明,苹果和梨首先聚类,其次是毛果杨.

关键词：苹果、GA2ox、保守结构域、氨基酸同源性分析、氨基酸聚类分析

所属期刊栏目：27

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：山东省良种工程项目;青岛市科技计划基础研究项目11-2-4-54-jch

在线出版日期：2013-01-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：55-59