7种作物叶绿体基因的密码子偏好性及聚类分析

摘要：

研究作物叶绿体蛋白编码基因的编码特点,对指导农作物的叶绿体基因工程研究设计,促进外源基因在受体作物中的高效、稳定表达具有重要作用.为此,综合运用了多种分析软件,对7种大田作物的叶绿体蛋白编码基因进行分析.结果表明:叶绿体蛋白编码基因的总碱基构成在7种作物中差异不大,都是A含量最高,而G,C的含量较低；但在密码子第3位的碱基构成上却有明显差别,3种双子叶作物偏爱以C,T结尾的密码子,而禾本科的4种作物则偏爱以T,C结尾的密码子；RSCU(同义密码子的相对使用度)值显示出禾本科作物有26个密码子具有偏好性,而双子叶作物有25个密码子具有偏好性,但二者之间有22个相同的偏好性密码子.基于RSCU值的聚类结果显示,植物的密码子偏好性具有种族特征,表明基于叶绿体蛋白编码基因的密码子使用特性的聚类结果可以作为系统发育分析的重要补充.

关键词：作物、叶绿体基因、密码子偏好性、聚类分析

所属期刊栏目：27

分类号：Q349+.55(遗传学分支学科)

资助基金：农业部转基因生物新品种培育科技重大专项2009ZX08002-002B,2009ZX08002-014B

在线出版日期：2012-11-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：60-64