高粱微卫星分析中遗传完整性样本量的确定

摘要：

采用微卫星分析高粱不同样本量对遗传多样性指数的影响,从而确定最佳样本量,为遗传完整性研究奠定基础.试验设置了10个样本量梯度,对群体的等位基因数目、有效等位基因数目、香农指数、观察杂合度、预期杂合度、多态位点百分数和稀有等位基因频率的变化趋势进行了分析.结果表明,10～40个样本量范围内,等位基因数目、有效等位基因数目、香农指数、多态位点百分数随着样本量的增大而增大；在40个样本量时,等位基因数目、有效等位基因数目和香农指数达到较高值,分别代表了100个群体98.5％的等位基因数、99.1％的有效等位基因数和98.5％的香农指数,之后样本量继续增加,各指标变化不显著.稀有等位基因频率在40个样本量以上,随着样本量的增加数值变化很小.以稀有等位基因频率、等位基因数、有效等位基因数和香农指数为多样性指标,在高粱遗传完整性研究中样本量大小的确定上达到一致性.因此,建议在用SSR技术对高粱进行遗传完整性分析时,样本量要选择40个单株以上.

关键词：高粱、样本量、遗传完整性

所属期刊栏目：27

分类号：S514.03(禾谷类作物)

资助基金：国家科技支撑项目2006BAD13B10;农作物种质资源保护利用专项2130135

在线出版日期：2012-11-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：108-114