牡丹SCoT分子标记正交优化及引物筛选
以牡丹基因组DNA为模板,采用L16(45)正交试验设计对影响目标起始密码子多态性-聚合酶链式反应( SCoT-PCR)的五因素(Taq酶用量、Mg2+浓度、模板DNA用量、dNTPs浓度和引物浓度)进行优化试验,建立了优化的牡丹SCoT-PCR反应体系:Mg2+ 2.50 mmol/L、dNTPs 0.25 mmol/L、引物0.60 μmol/L、Taq DNA聚合酶0.50 U、模板DNA 1.00 ng/μL,1×PCR-Buffer,总体积20.00 μL.比较各因素对扩增反应的结果,其中以Mg2+浓度的影响最大,DNA模板用量的影响最小.运用牡丹17个品种验证了该体系稳定可靠,并从36个SCoT引物中筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的24个引物.这一体系的建立及多态性引物的筛选为今后利用SCoT标记技术对牡丹进行相关研究提供了科学依据.
牡丹、SCoT-PCR、反应体系、正交设计、引物筛选
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S567.03(经济作物)
国家自然科学基金31070620;河南省重大科技攻关项目091100110100;河南省重点科技攻关项目092102110024;洛阳市科技攻关项目0802017A
2012-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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