陆地棉Dirigent-like基因(GhDIR)的克隆与分析

摘要：

Dirigent-like基因(DIR)编码蛋白质参与木质素的形成,与植物体的病菌防御有关.本研究以抑制差减杂交( SSH)技术获得DIR的EST为信息探针,对棉花EST数据库进行同源搜索和序列拼接,获得了全长为768 bp的DIR基因cDNA全长,将该基因命名为GhDIR.该基因序列的开放阅读框(ORF)位于70 ～594 bp,推测编码175个氨基酸残基的蛋白.用陆地棉基因组DNA和cDNA分别进行了PCR扩增验证,克隆测序结果表明,所得GhDIR序列与电子克隆序列完全一致,没有内含子.序列比对和系统进化分析表明,该基因与海岛棉的同源序列表现了最高的相似性,与其他双子叶植物同源序列的相似性次之,而与单子叶植物同源序列的相似性较远.实时定量PCR表达谱分析表明,该基因在陆地棉幼苗根部受黄萎病菌诱导表达.

关键词：陆地棉、电子克隆、DIR-like gene、表达分析、大丽轮枝菌

所属期刊栏目：26

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家转基因生物新品种培育科技重大专项2008ZX08005-001

在线出版日期：2012-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：29-33