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FMDV Asia1/HeB病毒株结构蛋白基因的克隆测序及B细胞抗原表位预测

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对口蹄疫病毒Asia1/HeB株P1结构蛋白基因进行了扩增、克隆及序列测定.采用DNAStar Protean软件对P1蛋白的二级结构、可塑性、亲水性、表面可及性及抗原指数等参数进行分析,综合预测其B细胞表位分布.结果表明,FMDV Asia I/HeB株P1基因长2 199 bp,包含完整的开放阅读框,编码733个氨基酸,其中VP1长633 bp,编码211个氨基酸,VP2长654 bp,编码218个氨基酸,VP3长657 bp,编码219个氨基酸,VP4长255 bp,编码85个氨基酸.P1结构蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的β片层结构和转角结构,VP1、VP2和VP3上均有多个区域为B细胞优势表位,VP4上也有少量的潜在B细胞表位.与已鉴定的B细胞表位相比较,该方法预测的结果有较高的准确度.为试验确定FMDV AsiaI/HeB株P1结构蛋白的B细胞表位和反向疫苗学设计提供了理论基础.

口蹄疫病毒、结构蛋白、测序、B细胞表位

24

Q78(基因工程(遗传工程))

国家支撑计划项目2006BAD06A06

2009-10-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共7页

57-63

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华北农学报

1000-7091

13-1101/S

24

2009,24(4)

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