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FMDV OA/58病毒株VP3蛋白结构的模拟与分析

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以口蹄疫病毒株OA/58 RNA为模板,反转录并扩增目的cDNA ,然后与pMD18-T载体连接并转化JM109菌株,提取的重组质粒用凝胶电泳、PCR和BamH I、Hind III双酶切法鉴定.分析表明,口蹄疫病毒VP1、VP2、VP3和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(p>0.05);而它们在氨基酸水平上的变异率差异显著(p<0.05).该毒株与20株源于GenBank中的VP3氨基酸序列比较发现其保守区主要位于第1~24、26~35、37~43、45~57、61~122、124~173、175~209、211~220位.运用同源模建,OA/58 VP3蛋白三维空间结构可分为A,B,C 3个结构区域.保守区氨基酸残基在维持VP3蛋白的空间构象和功能方面具有重要作用.

口蹄疫病毒、VP3蛋白、同源模建

23

Q945(植物学)

国家科技支撑计划2006BAD06A14,2006BAD06A10

2009-03-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共4页

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华北农学报

1000-7091

13-1101/S

23

2008,23(6)

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