杜鹃花表达序列标签资源中的微卫星信息分析

摘要：

从NCBI数据库下载杜鹃花表达序列标签序列1 323条,去冗余后得到912条EST.采用Tandem repeat finder软件分析,最终在61条EST序列中找到65个SSR位点,出现频率为7.127 2％.二碱基重复是杜鹃花EST内SSR的主要重复类型,占66.153 8％;单碱基和三碱基重复次之,分别占据15.384 6％和9.230 8％.四碱基、五碱基、六碱基类型的SSR相对比较少.多达90.769 2％的SSR位点为完美型微卫星重复.这些富含SSR位点的EST序列将为开发微卫星特异性引物,并用于杜鹃花群体生物多样性和遗传结构分析提供理论依据.

关键词：杜鹃花、微卫星、表达序列标签、遗传多样性

所属期刊栏目：43

分类号：Q786;S685.21(基因工程（遗传工程）)

资助基金：经济林木种质改良与资源综合利用湖北省重点实验室开放基金项目“麻城龟峰山杜鹃群落结构组成及空间分布格局分析”2013000403

在线出版日期：2014-06-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：7-10