Lotus japonicus共生固氮基因的比较基因组学

摘要：

以模式植物Lotus japonicus基因组为研究对象,首先应用了现有生物信息学软件BLAST程序对Lotus japonicus的全基因组序列进行了比较分析,鉴定两个序列之间的相似性并将其基因筛选出来；其次结合Blastp的数据结果提供的基因同源信息,和基因在染色体上的位置信息,对其全基因组进行共线性分析确定基因组中由WGD产生的重复基因有2197对,以获得Lotus japonicus多倍化发生的规模高达28.05％；再次在NCBI上初步搜索并获得与共生固氮相关的基因序列有12个同时根据获得的共生固氮相关的基因在四个禾本科物种中进行比较分析,并且对其进行了简单的系统进化分析,发现全基因组倍增可能有利于共生固氮相关的基因家族的扩增.

关键词：固氮基因、比较基因组学、基因培增、系统发育树

所属期刊栏目：35

分类号：Q945.13(植物学)

资助基金：国家自然科学基金项目31100913;河北省教育厅项目Z2011126;大学生创新性实验计划项目X2011047

在线出版日期：2013-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：92-96,102