大肠杆菌MurD抑制剂的分子对接与3D-QSAR研究

摘要：

UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(MurD)在细胞质中催化D-谷氨酸(D-Glu)和UDP-N-乙酰胞壁酰-￡-丙氨酸(UDP-MurNAc-L-Ala)之间的酰胺键形成UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸-D-谷氨酸(UDP-MurNAc-L-Ala-D-Glu).由于MurD对D型氨基酸表现出非常高的特异性,使得它被认为是发现选择性抗菌剂的新靶标之一.通过利用从相关文献中获取的31个大肠杆菌MurD抑制剂建立3D-QSAR预测模型.以分子对接获得的打分较高的活性构象为模版,对选择的分子进行叠合,从中随机选择26个化合物作为训练集建立比较分子场分析(CoM FA)模型,该模型的去一交叉验证(LOO)相关系数q2=0.515 (CoMFA).剩余的5个化合物组成测试集以验证模型的预测性能,相应的相关系数R2press =0.701 8(CoMFA).结果表明建立的CoMFA模型具有较好的预测能力,研究结果将为今后的MurD抑制剂设计和开发提供参考信息.

关键词：大肠杆菌MurD抑制剂、分子对接、CoMFA、3D-QSAR模型

所属期刊栏目：40

分类号：R914.2(药物基础科学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目30471432;中南民族大学中央高校业务基金CZY17015

在线出版日期：2018-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：462-469