甘蓝型油菜SHR蛋白基因鉴定与结构分析

摘要：

植物SHR蛋白属于GRAS蛋白转录因子家族,保守羧基端含有VHIID结构域,氨基端不保守,参与调控植物物质合成和生长发育.参照拟南芥AtSHR基因的CDS序列,采用生物信息学的方法在甘蓝型油菜数据库中鉴定出3个BnSHR基因,进而分析其基因结构、生化特性、进化关系和蛋白结构.研究结果显示3个BnSHR基因中有2个位于C基因组(来源于甘蓝)上,1个位于A基因组(来源于白菜);3个BnSHR基因的氨基酸序列一致性为88.25％,与AtSHR基因在进化上也高度同源,SHR基因在结构和功能上保守;亚细胞定位预测显示BnSHR蛋白可能定位于过氧化物酶体,参与种子萌发过程中脂肪转变为糖分的过程;PHYRE2预测了BnSHR蛋白的三级结构,由于序列的差异性导致了氨基末端处结构相差较大,但VHIID保守区结构类似,为β-折叠.

关键词：甘蓝型油菜、SHR基因、基因结构、氨基酸序列、三级结构

所属期刊栏目：39

分类号：S565.4(经济作物)

资助基金：国家自然科学基金31501820

在线出版日期：2018-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：620-627