1株抗生素耐药微小脲原体hebnu3 h07的全基因组测序及序列分析

摘要：

目的 对1株从患者标本分离出的具有耐药性的微小脲原体 hebnu3h07进行全基因组测序和生物信息学分析,为深入研究微小脲原体的基因组学特征及耐药机制提供依据.方法 对从临床分离的微小脲原体hebnu3h07株进行培养鉴定并进行药敏试验,采用 Ion torrent高通量测序技术对其进行全基因组测序,再使用相关软件对测序数据进行基因组组装、基因预测与功能注释、共线性分析、直系同源簇(COG)聚类分析、菌株分型和介导耐药的相关基因检测分析.结果 微小脲原体 hebnu3h07株对数种抗生素表现出不同程度的耐药性,其完整基因组大小为723292 bp,GC含量为25.4%,与现存3株微小脲原体完整序列比对发现其基因组序列较为保守,多位点序列分型属于 ST1型,对介导耐药的基因检测发现数个突变位点.结论 通过对此株抗生素耐药的微小脲原体的全基因组测序和导致耐药的基因位点分析,丰富了我国微小脲原体基因组数据,为微小脲原体的耐药机制研究提供了依据.

关键词：微小脲原体、解脲脲原体、全基因组、耐药性

所属期刊栏目：34

分类号：Q344+12(遗传学分支学科)

在线出版日期：2018-02-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1-7,13