β-珠蛋白基因远程相互作用元件的筛选与功能性分析

摘要：

目的:研究表明β-珠蛋白基因在发育过程中呈现选择表达的转换机制,其上游的基因座位点控制区(LCR)调控了β-珠蛋白基因家族的表达模式.为了深入探究β-珠蛋白基因表达调控的分子网络,本文对其他可能参与调控β-珠蛋白基因表达的远程调控元件进行筛选,对β-珠蛋白基因动态调控转换机制进行深入研究.方法:早幼粒细胞经全反式维甲酸诱导分化,以β-珠蛋白基因启动子区及LCR作为环形染色体构象捕获(4C)技术分析的靶位点,通过测序技术与调控元件分析结合,在全基因组筛选与β-珠蛋白家族基因座位发生相互作用关系的位点.结果:根据4C测序结果,筛选出与HBD启动子区及LCR存在相互作用关系的位点.通过染色体构象捕获(3C)验证,结果与测序结果一致.通过甲醛辅助分离调控元件技术及Epiregio在线网站对调控元件功能性分析,结果表明筛选位点AC105129.4、AL354707.17、AC078785.22及AC021646.35均为潜在的参与β-珠蛋白基因调控元件.结论:4C筛选位点与锚定位点相互作用表明了β-珠蛋白家族基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式.

关键词：β-珠蛋白基因、环形染色体构象捕获、染色质相互作用、染色体构象捕获

所属期刊栏目：28

分类号：R346(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：国家自然科学基金;海南省自然科学基金高层次人才项目;海南省研究生创新课题

在线出版日期：2023-02-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1841-1847