脑胶质瘤中miR-29b-3p核心靶基因的鉴定与分析

摘要：

目的:探讨miR-29b-3p在脑胶质瘤中的核心靶基因,并分析核心靶基因的临床意义.方法:采用生物信息学分析方法预测、筛选miR-29b-3p的靶基因;使用STRING、Cytoscape软件分析靶基因的蛋白间互相作用(protein-protein interaction,PPI);用GEPIA、CGGA分析其在胶质瘤中的不同状态下的表达差异及生存预后,单因素、多因素Cox比例风险回归模型分析影响预后的独立因素.结果:通过LinkedOmics、miRDB、miRTarBase、TargetScan和starbase数据库预测出22个miR-29b-3p的靶基因,通过构建PPI网络,去除未参与网络关系的基因,综合GEPIA与CGGA数据库分析,剔除COL2A1、DNMT3A和DNMT3B,进一步通过多因素Cox比例风险回归模型分析,最终确定3个核心靶基因:SERPINH1、LOXL2、CDK6.结论:生物信息学分析显示miR-29b-3p在脑胶质瘤中靶向SERPINH1、LOXL2、CDK6基因,各基因的表达量在正常脑组织与肿瘤组织间、肿瘤不同级别间、IDH突变状态和1p/19q共缺失状态下存在差异,其高表达对总生存预后、无复发生存预后存在不良影响,且可作为独立预后因素.

关键词：脑胶质瘤;miR-29b-3p;靶基因;预后;生物信息学

所属期刊栏目：28

分类号：R739.41(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;海南省重点研发计划项目;海南省研究生创新科研课题

在线出版日期：2022-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：258-262,268