MBL2与MASPs家族蛋白质相互作用的生物信息学分析

摘要：

目的:通过生物信息学方法对甘露糖结合凝集素2(MBL2)蛋白与甘露聚糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶(MASPs)家族蛋白质的相互作用进行全面预测分析.方法:使用同源建模(Swiss-model)和折叠识别(Phyre2)分别来构建MBL2蛋白与MASPs家族蛋白质的结构,使用STRING数据库及ZDOCK3.02预测分析MBL2与MASP1、MASP2两个蛋白质的相互作用情况.结果:MBL2与MASP1和MASP2均存在直接相互作用,并且和COLEC11、COLEC10、FCN2、C4B等构成相互作用网络.MBL2与MASP1结合位点和MASP2的结合位点高度重叠.MBL2参与结合MASP1的残基,大部分(77％)也参与了与MASP2的结合,表明MBL2是通过同一个区域,分别与MASPs家族的蛋白质相互作用.结论:MBL2与MASPs家族蛋白质之间作用密切,从而可能在补体系统激活及机体免疫防御等方面发挥重要的作用.

关键词：甘露糖结合凝集素2、丝氨酸蛋白酶、生物信息学

所属期刊栏目：25

分类号：Q811.4;Q51(生物工程学(生物技术))

资助基金：国家自然科学基金81860347;海南省自然科学基金818MS140;海南省科协青年科技英才创新计划项目QCXM201816;海南省卫生计生行业科研项目18A200178;军事医学创新工程专项18CXZ002

在线出版日期：2019-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1121-1124,1129