基于数据挖掘的PFKFB4在宫颈癌中的表达和基因调控网络研究

摘要：

目的 研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)的表达水平与宫颈癌患者临床病理特征和预后的关系,并探讨PFKFB4在宫颈癌进展中的调控网络.方法 利用Linked Omics数据平台分析PFKFB4的表达与宫颈癌患者临床病理特征及预后的关系.利用Linked Omics的Link Finder模块Gene Set Enrichment Analysis(GSEA)对差异相关基因进行基因本体(GO)[细胞成分(CC),生物过程(BP)和分子功能(MF)]分析.KEGG信号通路分析激酶靶标富集,miRNA靶标富集和转录因子靶标富集.cBioPortal用于分析PFKFB4在宫颈癌中的变异频率和类型.Gene MANIA用于分析与PFKFB4存在相互作用的基因以及主要涉及的功能.结果 PFKFB4与宫颈癌的T分期、N分期和M分期显著相关;T分期越高、有淋巴结转移(N1)、伴有远处转移(M1)者PFKFB4表达量越高;PFKFB4高表达患者的总生存显著差于低表达患者(P=0.002);GO分析提示PFKFB4相关基因与蛋白结合、离子结合、核酸结合、水解酶活动、转移酶活动等相关;KEGG信号通路富集分析则发现,PFKFB4及相关基因在宫颈癌中主要参与了缺氧诱导因子HIF1信号通路、糖酵解/糖再生信号通路、果糖和甘露糖代谢通路等;GSEA分析显示,MK2PK1、CHEK1、miR-200a、miR-18a、HIF1、AP1与PFKFB4的表达显著相关;cBioPortal分析显示,PFKFB4在宫颈癌中主要变异形式为mRNA高表达,但是突变频率较低.结论 PFKFB4是宫颈癌一个潜在的预后标记物.通过数据挖掘揭示了PFKFB4的潜在调控网络信息,为进一步研究PFKFB4在宫颈癌中的作用奠定基础.

关键词：6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4;宫颈癌;生物信息学;诊断;预后

所属期刊栏目：33

分类号：R737.33(肿瘤学)

资助基金：广东省广州市卫生健康科技项目20191A011016

在线出版日期：2022-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：137-142