基于生物信息学分析的乳腺癌4-miRNAs预后模型

摘要：

目的 构建乳腺癌患者微小RNA(miRNA)预后模型,为其个体化管理提供理论依据.方法 从TCGA(the Cancer Genome Atlas)数据库下载乳腺癌的miRNA、mRNA表达谱及临床数据,通过单因素和多因素COX回归分析构建miRNA预后模型,采用受试者工作特征曲线(ROC)及曲线下面积(AUC)检验模型的敏感性和特异性;通过靶基因预测软件预测4-miRNAs模型的靶基因,将得到的靶基因与乳腺癌中差异表达的mRNA取交集后进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析;通过STRING网站构建PPI网络(protein protein interaction network);通过Cytoscape3.8.2软件筛选出4-miRNAs模型的核心基因.结果 4-miRNAs预后模型中实验组、验证组及所有样品组预测乳腺癌患者5年生存率ROC曲线下AUC值分别为0.868、0.669、0.802;单因素Cox回归分析提示4-miRNAs预后模型与总生存率相关(HR=1.325,P=0.005),多因素Cox回归分析提示4-miRNAs预后模型可作为影响乳腺癌患者生存率的独立预后因素(HR=1.325,P=0.006).结论 4-miRNA模型能够有效预测乳腺癌患者预后,建议针对高风险型患者采取积极的治疗手段.

关键词：miRNA、乳腺癌、预后模型、TCGA、生物信息学

所属期刊栏目：32

分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：贵州省科技计划项目编号:黔科合J字LKZ[2013]54号、黔科合LH字[2016]7483号;贵州省遵义市科技计划项目

在线出版日期：2021-04-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：817-820