LncRNA AC008871.1的鉴定及在肝癌中的表达

摘要：

目的 探讨长链非编码RNA AC008871.1的鉴定及在肝癌中的表达,并预测其靶基因.方法 应用USCS数据库检索其位置、CPC数据库分析其编码能力、Ensembl数据库预测其靶基因;再通过实时荧光定量PCR技术分析AC008871.1在4种肝癌细胞系(SK-Hep1、HepG2、Huh7、97L)与正常细胞系(L-02)中的差异表达,以及在肝癌组织与癌旁组织中的差异表达,并分析其与临床数据的关系.结果 经数据库检索,AC008871.1位于5号染色体长臂,酪氨酸激酶FER基因3号至4号外显子之间的3号内含子的反义链上,其编码能力很弱,为非编码RNA,预测其靶基因可能为FER;经荧光定量分析,AC008871.1在不同肝癌细胞系中相对表达量均低于正常细胞,与L-02的(1.00±0.00)相比,在SK-Hep1、HepG2、Huh7、97L中的相对表达量依次是(0.32±0.22)、(0.49±0.08)、(0.83±0.03)、(0.42±0.03),差异均有统计学意义(P<0.05);肝癌组织中AC008871.1的相对表达量均低于癌旁组织[(0.29±0.21)vs 1.00],差异有统计学意义(P<0.05);有吸烟史的肝癌组织中,AC008871.1的基因表达水平为(0.40±0.22),明显高于无吸烟的肝癌组织的(0.17±0.10),差异有统计学意义(P<0.05);HBEAb正常的肝癌组织中,AC008871.1的基因表达水平为(0.41±0.20),明显高于不正常的肝癌组织的(0.16±0.12),差异有统计学意义(P<0.05).结论 AC008871.1差异表达可能与肝癌的发生、发展有密切联系,有望作为新的肝癌预后标志物和治疗靶点.

关键词：长链非编码RNA、实时荧光定量PCR、AC008871.1、肝癌、酪氨酸激酶

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分类号：R735.7(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金81460432、81572994;广西自然科学基金2015GXNSFDA139017;广西科学研究与技术开发计划项目15104001-7;广西南宁青秀区科学研究与技术开发计划项目2014S03

在线出版日期：2019-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：137-141