PCR直接测序法在脓肿分枝杆菌鉴定中的应用

摘要：

目的：探讨聚合酶链式反应(Polymerase chain reaction，PCR)与DNA测序技术鉴定脓肿分枝杆菌的效果。方法利用细菌16S rRNA基因通用引物PCR扩增疑似分枝杆菌的16S rRNA基因的DNA片段并进行DNA测序分析。DNA测序获得序列经生物信息学比对分析获得相关分枝杆菌的信息；针对相关分枝杆菌分别设计非同源区域特异性引物对1500 bp的克隆DNA片段扩增验证。结果细菌16S rRNA基因通用引物扩增获得约1500 bp的DNA片段，但DNA测序仅获得其中部分DNA序列约296 bp；部分DNA序列经生物信息学比对分析后获得四种同源性高达98%的分枝杆菌信息，并且四种分枝杆菌的特异性引物对1500 bp的克隆产物进行扩增后仅在脓肿分枝杆菌中获得特异性PCR产物。结论疑似结核患者体内的抗酸染色阳性菌为非结核分枝杆菌中的脓肿结核分枝杆菌，并且PCR直接测序法可快速鉴定细菌的种属。

关键词：聚合酶链式反应、DNA测序、16S rRNA、生物信息学、脓肿分枝杆菌

分类号：R378.91(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：昆山市科技计划项目编号KS1347

在线出版日期：2014-12-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：3342-3345