羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及B细胞和T细胞抗原表位预测

摘要：

为了预测羊口疮病毒ORFV113蛋白的主要特性及其优势B细胞和T细胞抗原表位,分别利用在线软件ProtParam预测ORFV113蛋白的理化性质,DeepTMHMM预测其跨膜区,SignalP 6.0预测其信号肽,SOPMA预测其二级结构,PSORT预测其亚细胞定位,ABCpred预测其优势B细胞表位,IEDB预测其优势细胞毒性T细胞表位.结果:ORFV113蛋白由208个氨基酸组成,为不稳定亲水性蛋白,分子质量约22.08 ku,理论等电点(PI)为4.36,在3～25 aa处存在 1 个跨膜区,不含信号肽,主要定位于细胞质膜;ORFV113蛋白的二级结构由延伸链(16.35%)、α-螺旋(23.08%)、β-转角(4.81%)、无规则卷曲(55.77%)组成;ORFV113蛋白存在11个优势B细胞表位,分别位于164～179 aa、62～77 aa、132～147 aa、120～135 aa、138～153 aa、101～116 aa、56～71 aa、188～203 aa、175～190 aa、49～64 aa、108～123 aa;存在3个优势T细胞表位,分别位于 63～71 aa、121～129 aa、162～170 aa.结论:ORFV113蛋白为亲水性的跨膜蛋白,含有多个优势B细胞和T细胞抗原表位,可作为多表位疫苗的靶点.

关键词：羊口疮病毒、ORFV113 蛋白、蛋白特性、B细胞抗原表位、T细胞抗原表位

所属期刊栏目：47

分类号：S852.65:Q7(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家级大学生创新创业训练计划项目;羊口疮病毒蛋白的转录动力学;真核表达;亚细胞定位研究贵州大学实验室开放项目;基于ceRNA调控网络的基因的毒力功能研究贵州省科学技术基金

在线出版日期：2023-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：45-48