G蛋白偶联受体109B同源模建及药物对接研究

摘要：

膜蛋白G蛋白偶联受体（GPR）109B因无晶体结构而难以了解其活性位点及其与化合物药物的作用机制，我们利用同源模建方法构建GPR 109B的三维结构，用分子动力学等方法进行优化，采用Profile－3D和拉氏图评估后得到最优蛋白质模型。在此结构上利用寻找蛋白中可能的结合位点，利用分子对接方法将3－硝基－4－氨基苯甲酸类药物分子进行对接至GPR 109 B蛋白的各个活性位点，根据对接数据和结构图分析可知，蛋白的部分活性位点是潜在药物靶点位置，3－硝基－4－氨基苯甲酸类药物与蛋白的半胱氨酸，缬氨酸，苯丙氨酸，异亮氨酸，脯氨酸等氨基酸有直接作用，能够形成分子间氢键。根据3－硝基－4－氨基苯甲酸类基本结构和蛋白作用活性靶点氨基酸，进一步修饰药物分子，设计新的此类药物衍生物。本实验对治疗心脑血疾病和由烟酸降脂引起的持续低压药物的设计有一定的理论指导作用和应用价值。

关键词：G蛋白偶联受体109B、同源模建、活性位点、分子对接

分类号：R914(药物基础科学)

资助基金：辽宁省大学生创新创业训练计划项目201411258015；大连大学大学生创新训练计划项目2014068。

在线出版日期：2015-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：23-26