西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性分析

摘要：

本研究旨在分析一株西藏牦牛源多杀性巴氏杆菌OmpH基因的遗传进化、分子特征和抗原性.从一株西藏牦牛源B型多杀性巴氏杆菌的全基因组测序中获得OmpH基因序列,对其核苷酸序列进行遗传进化分析,通过生物信息学软件在线对OmpH基因编码的氨基酸序列进行理论分子质量、理论等电点、亲水性和疏水性、跨膜结构、结构域、二、三级结构及抗原性分析.结果表明OmpH基因全长1002 bp,编码333个氨基酸;遗传进化分析发现,西藏牦牛源Pm的OmpH基因与新疆牦牛源的同源性最近.OmpH蛋白的分子特性分析发现该蛋白为亲水性蛋白,较为稳定,具有信号肽结构,所有序列均在膜外,无跨膜结构,属于分泌型蛋白,在PFAM数据库中存在Porin_1结构域及低复杂性区域;该蛋白的二、三级蛋白结构分析发现分子同源三聚体构成,其中无规则卷曲占比45.35％,结构较为稳定.抗原性分析OmpH蛋白的保护性抗原的总体预测为0.6945,高出正常阈值0.2945.OmpH具有抗原性的可能性较大,可作为免疫原性蛋白和多杀性巴氏杆菌疫苗的较佳候选抗原.

关键词：牦牛、多杀性巴氏杆菌、OmpH基因、遗传进化、分子特征、抗原性

所属期刊栏目：6

分类号：S812-05(普通畜牧学)

资助基金：西藏自治区科技厅重点项目;西藏农牧学院创新创业示范高校建设——大学生创新创业训练示范计划项目;国家肉牛牦牛产业技术体系项目

在线出版日期：2023-02-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：40-49