藜科植物藜和灰绿藜实时荧光定量PCR内参基因的选择

摘要：

选择合适的内参基因是实时荧光定量PCR(qRT-PCR)研究的关键,目前对藜科耐盐(盐生)植物胁迫相关基因的表达分析中所用内参基因的报道较为有限.该研究利用GeNorm、NormFinder和BestKeeper 3个内参基因分析软件,对已选择过的β-TUBULIN、β-ACTIN、GAPDH 3个常用候选内参基因进行了比较分析,筛选出在NaCl和PEG胁迫下藜和灰绿藜中表达相对稳定的内参基因.结果表明:GeNorm、NormFinder内参软件分析在NaCl和PEG胁迫下,GAPDH是藜和灰绿藜中均共同稳定表达的内参基因,同时在藜和灰绿藜中也有各自表达较稳定的内参基因,β-ACTIN在藜中稳定表达,β-TUBULIN则在灰绿藜中稳定表达.对相同科不同种的植物内参基因表达差异进行比较,内参基因在相同科中具有相同稳定表达的内参;对相同胁迫下两种不同植物内参基因表达稳定性进行分析,内参基因的选择需根据实际的实验材料和实验条件而定.基于3个分析软件对以上3个常用内参基因的分析结果,初步确定了在藜科植物藜和灰绿藜中相对稳定的内参基因,为藜和灰绿藜胁迫相关基因的定量表达分析提供了参考依据.

关键词：藜、灰绿藜、实时荧光定量PCR、内参基因、胁迫

所属期刊栏目：36

分类号：Q945.11(植物学)

资助基金：国家自然科学基金31260037, 31460043, 31660068;新疆自治区优秀青年科技人才培养项目2013721013 [Supported by the National Natural Science Foundation of China31260037, 31460043, 31660068;Program for Training Young Talents of Xinjiang Uygur Autonomous Re-gion 2013721013]

在线出版日期：2017-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1511-1518,1459