缺血性脑卒中缺氧免疫关键基因的鉴别及诊断价值分析

摘要：

目的:研究缺血性脑卒中(IS)缺氧免疫机制的相关差异表达基因和调控信号通路,以识别IS潜在诊断生物标志物.方法:从GEO数据库下载IS表达谱数据集GSE58294,采用单样本GSEA(ssGSEA)和t分布随机邻域嵌入算法(t-SNE)评估受试者的缺氧和免疫状态,使用"limma"软件包筛选差异基因(DEGs),通过DAVID在线数据库对DEGs进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,LASSO筛选与IS关键(hub)基因,然后运用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)验证hub基因的差异性表达.结果:筛选出60个IS缺氧免疫DEGs,KEGG结果显示IS缺氧免疫DEGs富集在PI3K-Akt通路,LASSO筛出6个关键基因:CHPF2、MBOAT2、IL18RAP、TIMM8A、ALDOAP2、LPAR4.CHPF2、MBOAT2和IL18RAP为上调基因(均P＜0.001),而TIMM8A、ALDOAP2和LPAR4为下调基因(均P＜0.001),ROC曲线显示该6个关键基因的AUC为0.894 1～0.994 3.RT-qPCR结果显示,短暂性大脑中动脉闭塞(tMCAO)小鼠中MBOAT2和IL18RAP的表达显著高于假手术小鼠(均P＜0.001).结论IL18RAP和MBOAT2可能为IS缺氧免疫相关的DEGs,并可作为IS的潜在诊断生物标志物.

关键词：缺血性脑卒中、缺氧、免疫、MBOAT2、IL18RAPT

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分类号：R722(儿科学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;广西壮族自治区自然科学基金资助项目;广西壮族自治区自然科学基金资助项目

在线出版日期：2023-10-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1274-1282