2012-2022年广西HIV-1独特重组型毒株近似全长基因序列特征分析

摘要：

目的:研究广西HIV-1独特重组型毒株(URFs)的基因重组特点,为广西HIV-1疫情防控提供科学依据.方法:对1例pol区基因序列初步判断为URF的HIV-1感染者的血液样本进行RNA提取、巢式PCR扩增全长基因并测序,从PubMed等数据库检索2012-2022年发表的有关广西URFs近似全长基因组的文章及对应的序列,构建系统进化树,并进行重组模式、断点分析和耐药突变位点分析.结果:测序获得1例长度约8.9kb的URF,该URF是以CRF08_BC为骨架插入CRF01_AE片段构成的二代重组毒株.将该URF与数据库中检索到的12例广西URFs共同分析,发现广西URFs主要来源于性传播途径感染者和静脉吸毒感染者.所有URFs均包含CRF01 AE片段,以01 AE/07 BC重组比例最高(69.2％,9/13),1例URF含有主要耐药位点.结论:广西已鉴定的URFs数量较少,以01 AE/07_BC重组为主,应加强对URFs的监测和鉴定,以全面了解广西HIV-1重组毒株的特点.

关键词：人类免疫缺陷病毒、独特重组型毒株、重组特征

所属期刊栏目：40

分类号：R512.91;R181.3(传染病)

资助基金：国家自然科学基金;广西重点研发计划资助项目

在线出版日期：2023-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：199-205