KTN1在肾透明细胞癌中的表达及临床意义

摘要：

目的:探索激动素1(KTN1)在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达变化和临床意义.方法:利用TCGA数据库中533例KIRC组织以及72例正常对照组织转录组数据,分析KTN1在KIRC中mRNA表达变化,及其与患者临床病理指标的相关程度和生存时间的关联,并分析KTN1 mRNA表达水平作为KIRC的诊断效能;利用GEO数据库对662例KIRC组织样本和268例正常对照组织样本进行KTN1 mRNA表达水平的meta分析;采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测KTN1在KIRC细胞系以及组织中的转录水平;利用UALCAN数据库分析KTN1蛋白表达水平及其启动子区甲基化修饰水平;GSEA软件用于通路富集.结果:与正常对照组织比较,KIRC中KTN1 mRNA表达降低(P＜0.05).TCGA数据库分析发现,在远处器官转移、淋巴结转移以及Ⅲ～Ⅳ期患者中KTN1 mRNA表达水平较低(均P＜0.05).生存分析显示KIRC患者中KTN1低表达组预后不良(P=0.008).分别基于TCGA数据库和RT-qPCR结果绘制受试者工作特征曲线(ROC),发现曲线下面积(AUC)为分别为0.931(95％CI:0.894～0.948,P＜0.001)和0.867(95％CI:0.727～1.000,P＜0.001).KIRC 中 KTN1启动子区域的甲基化水平高于正常对照组织(P＜0.01),经5-aza-dC去甲基化处理后,KIRC细胞的KTN1 mRNA表达上调(P＜0.01);通路富集结果发现KTN1与异体移植排斥反应、干扰素γ反应等22个通路有关.结论:在KIRC中KTN1因高甲基化导致转录失活,并提示患者的不良预后,KTN1可能是KIRC潜在的诊断和预后分子标志物.

关键词：肾透明细胞癌、KTN1、诊断、预后、分子标志物

所属期刊栏目：39

分类号：R737.11(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;广西自然科学基金资助项目;教育部/广西重点实验室自主创新课题

在线出版日期：2023-01-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1542-1549