基于高通量测序的风湿性心脏病瓣膜组织mRNA差异分析

摘要：

目的:基于高通量测序(NGS)技术筛选风湿性心脏病(RHD)与非RHD患者的瓣膜组织中的差异mRNA.方法:选取2020-2021年在广西医科大学第一附属医院行二尖瓣置换术的RHD患者(RHD组)和非RHD患者(Con组),取瓣膜组织进行基因NGS,对显著差异基因进行基因功能(GO)富集分析和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路分析,然后通过蛋白相互作用(PPI)网络筛选关键基因,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证关键基因表达.结果:两组瓣膜组织共4 498个差异表达基因,其中2 315个上调,2 183个下调,显著差异表达有530个,筛选出FN1、CD44、VCAM-13个关键基因.与Con组比较,FN1、CD44、VCAM-1在RHD组瓣膜组织中的表达均上调(P＜0.05).GO分析结果显示,主要富集的生物学过程(BP)为细胞外基质(ECM)及结构的组装和分解,主要的细胞成分(CC)为细胞外基质,显著的分子功能(MF)为钙黏着蛋白结合和肌动蛋白结合.KEGG通路显著富集于细胞基质黏着、白细胞跨内皮转移、ECM受体相互作用等信号通路中.结论:NGS筛查出RHD患者与非RHD患者瓣膜组织中差异表达基因FN1、CD44、VCAM-1,可能在ECM受体相互作用和白细胞跨内皮转移等信号通路中发挥重要作用.

关键词：风湿性心脏病、高通量测序、mRNA

所属期刊栏目：39

分类号：R541.2(心脏、血管（循环系）疾病)

资助基金：国家自然科学基金No.81960082

在线出版日期：2022-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：596-600