肝细胞癌差异表达的癌-睾丸抗原筛选及表达初步验证

摘要：

目的:通过生物信息学方法筛选肝细胞肝癌(HCC)相关癌-睾丸抗原(CTA)并进行实验验证,为HCC免疫靶向治疗奠定基础.方法:通过GEPIA数据库筛选HCC中显著差异表达CTA,再用LinkedOmics数据库分析这些CTA与HCC预后的关系,并获取与这些CTA正相关的共表达基因集,进一步用DAVID数据库对这些CTA进行功能分析.共收集32例HCC组织,选择其中10例配对癌旁组织,通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CTAmRNA表达.结果:通过生物信息学的方法,筛选出HCC中5个显著差异表达且与预后相关的CTA:NUF2、PBK、KIF2C、OIP5和SPA 17;进一步对这5个CTA进行功能预测,发现它们主要参与转录及其调控、细胞分裂、纤毛形态发生等生物学过程,涉及细胞周期、剪接体及RNA运输等信号通路.RT-qPCR结果显示,NUF2和PBK在HCC组织中的表达显著高于癌旁组织.结论:CTA NUF2和PBK高表达于HCC,有望成为HCC潜在的治疗靶点.

关键词：肝细胞癌、癌睾丸抗原、生物信息学分析

所属期刊栏目：39

分类号：R961.1(药理学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家自然科学基金;广西自然科学基金资助项目;广西自然科学基金资助项目;广西自然科学基金资助项目;广西自然科学基金资助项目

在线出版日期：2022-06-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：589-595