急性心肌梗死与2型糖尿病相关差异基因的GEO芯片分析

摘要：

目的:利用生物信息学分析方法寻找与急性心肌梗死(AMI)和2型糖尿病(T2DM)相关的潜在基因,以揭示AMI与T2DM之间的潜在病理生理联系.方法:从GEO数据库下载AMI(GSE66360和GSE60993)和T2DM(GSE20966、GSE25724、GSE38642和GSE7014)的基因表达谱.通过R软件和公共网站等分析工具,获得差异表达基因和共同基因,并进行GO功能和KEGG途径富集分析、蛋白质相互作用(PPI)网络构建及统计分析,最终筛选出同时与糖尿病和急性心肌梗死均有较强相关性的关键基因.结果:最终识别出84个共同基因和10条KEGG通路(如人类传染病、破骨细胞分化、造血系统相关通路和炎症相关的信号传导途径).从构建的PPI网络结构中确定了10个相互作用程度较高的HUB基因,即IL1B、TLR2、FCER1G、Lil-rB2、TLR4、FPR1、ORM1、Ptgs2和FCGR2A.利用受试者工作特征曲线(ROC曲线)验证前6个关键基因(IL1B、TLR2、FC-ER1G、LILRB2、TLR4、FPR1)的诊断价值均较高.结论:本研究获取了10个可能在T2DM合并AMI发生和发展中起作用的关键基因,为预测糖尿病相关性急性心肌梗死提供一定的靶点参考.

关键词：AMI;T2DM;差异表达基因;生物信息学

所属期刊栏目：38

分类号：R587.1;R542.22(内分泌腺疾病及代谢病)

资助基金：国家自然科学基金资助项目No.03101217024D

在线出版日期：2021-10-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1666-1670