基于生物信息学数据库的肺腺癌组织中HMGB1表达及相关下游通路分析

摘要：

目的:通过生物信息技术探讨高迁移率族蛋白B1(HMGB1)促进肺癌进展的潜在关键通路和环节.方法:UALCAN数据库分析HMGB1表达相关的基因和相关基因的生存分析.STRING数据库分析蛋白质—蛋白质相互作用.AnimalTFDB3.0和JASPAR数据库预测转录因子以及结合位点.KEGG数据库分析相关信号通路.结果:生物信息分析结果显示细胞周期蛋白依赖激酶1(CDK1)、H2A组蛋白家族成员Z(H2AFZ)与HMGB1的表达在肺腺癌(LUAD)中呈正相关关系,且CDK1和H2AFZ与LUAD的不良预后有关.预测到SOX2和SP1是CDK1或H2AFZ的转录因子.信号通路分析结果显示Akt和ERK可以调控SOX2的表达.结论:CDK1、H2AFZ可能是HMGB1参与LUAD进展的重要节点,HMGB1-Akt/ERK-SOX2-CDK1/H2AFZ可能是HMGB1促进LUAD进展的关键通路.

关键词：高迁移率族蛋白B1、细胞周期蛋白依赖激酶1、H2A组蛋白家族成员Z、SOX2、SP1

所属期刊栏目：38

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;江苏省自然科学基金;江苏省政府留学奖学金项目;科技计划

在线出版日期：2021-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：734-740