宫颈鳞癌放疗抵抗中异常表达lncRNA相关ceRNA网络的 构建与分析

摘要：

目的:旨在基于TCGA数据库构建宫颈鳞状细胞癌(CSCC)放疗抵抗竞争性内源性RNA(ceRNA)网络,鉴定潜在的预测放疗疗效生物标志物及探讨放疗抵抗的机制.方法:依据纳入研究标准在TCGA数据库的宫颈癌数据集中筛选出23个CSCC放疗抵抗与67个放疗敏感样本的RNA表达谱数据,运行R"edger"包鉴定差异表达lncRNAs、miRNAs和mRNAs,基于miRcode、TargetScan和miRTarBase数据库构建ceRNA网络并通过Cytoscape软件可视化.进一步结合KEGG、GO及生存分析等生物信息学方法筛选出关键分子.结果:设定阈值为|log2差异倍数(FC)|>1.5且FDR<0.05,共鉴定出237个DElncRNAs,16个DEmiRNAs和565个DEmRNAs,其中17个DElncRNAs、3个DEmiRNAs和15个DEm-RNAs参与构建ceRNA网络.DEmRNAs富集到3个GO术语和8个KEGG途径(P<0.05).5个DElncRNAs在不同临床病理特征中有显著差异(|log2FC|>2且FDR<0.05).结论:成功构建CSCC放疗抵抗特异性lncRNA相关的ceRNA网络,鉴定了预测CSCC放疗疗效分子标志物,为理解CSCC产生放疗抵抗的机制提供理论依据.

关键词：宫颈鳞癌、放疗抵抗、竞争性内源性RNA、长链非编码RNA、癌症基因组图谱

所属期刊栏目：37

分类号：R711.74(妇产科学)

资助基金：广西医疗卫生适宜技术研究;开发资助项目;广西医科大学区域性高发肿瘤早期防治研究教育部重点实验室课题资助项目

在线出版日期：2020-07-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：23-28