长链非编码RNA LOC441178在口腔鳞癌中的生物信息学分析

摘要：

目的:通过生物信息学方法分析长链非编码RNA 441178(lncRNA,LOC441178)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达意义及预测其潜在生物学功能机制.方法:利用公共数据库收集LOC441178在OSCC中的表达数据,综合分析LOC441178表达水平与OSCC临床病理特征的关系.使用DAVID 6.8生物信息学丁具对LOC441178相关基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,预测LOC441178潜在的作用机制.结果:共纳入13篇文献,包括653个OSCC样本和262个对照样本.LOC441178在OSCC组织中的表达水平显著低于对照组(SMD=-1.60),并对OSCC的诊断价值较高(AUC=0.93).GEO数据集显示LOC441178与285个基因存在相关性.GO分析显示LOC441178可能影响脂肪酸代谢功能.KEGG分析表明,LOC441178可能通过ABC转运蛋白、丙酮酸代谢、脂肪酸降解等信号通路参与OSCC进程.结论:LOC441178在OSCC组织中的表达水平显著下调,可能通过调节脂肪酸代谢在OSCC发展过程中发挥重要作用.

关键词：口腔鳞状细胞癌、LOC441178、公共数据库、生物信息学

所属期刊栏目：36

分类号：R739.8(肿瘤学)

在线出版日期：2019-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：797-803