波纹鳜线粒体基因克隆及系统发育信息分析

摘要：

为了探讨鳜类线粒体基因组结构特征及系统发育信息,以期为鳜类遗传学研究和分子标记提供参考依据,本文将波纹鳜Siniperca undulata线粒体随机切割成长度为1～3 kb的15个片段,采用PCR产物直接测序法获得波纹鳜线粒体全基因组,并提交至NCBI数据库,获得登录号KJ644783.结果分析发现:波纹鳜线粒体包含13个编码蛋白基因、22个tRNA、2个rRNA以及一个超变区(D-loop),基因排列顺序与其他硬骨鱼类似,不存在基因重排现象.整个基因组存在明显的AC偏好性,其中G碱基含量非常低,仅仅为16.23％.系统发育信息分析结果显示,CO1、ND5、CYTB、ND4基因具有较好的进化适应性,能够较好地反映鳜类的系统发育关系.进一步的进化分析显示,鳜类分成了鳜属和少鳞鳜属.

关键词：波纹鳜、线粒体基因组、碱基偏好性、适应性、系统进化

所属期刊栏目：37

分类号：S961;Q959.483(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金31560718,31660741;贵州大学博士基金贵大人基合字〔2015〕01号

在线出版日期：2019-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：119-126