水稻南方黑条矮缩病毒湖南鼎城株系S10片段的基因组序列分析
运用RT-PCR技术克隆了水稻南方黑条矮缩病毒（southern rice black-streaked dwarf virus,SRBSDV）湖南鼎城株系的基因组S10片段（SRBSDV-HuNDCS10）,并对其全序列进行了测定和生物信息学分析。结果显示,SRBSDV-HuNDC S10片段全长为1797bp（登录号：JQ337964）,含有1个ORF,编码557个氨基酸残基的衣壳蛋白,推测分子量约62.6kD,推测等电点为7.62,与已报道的广东、海南和云南分离物病毒的S10作比较,它们的核苷酸相似性分别为99.7%、99.0%和98.4%,氨基酸相似性分别为100.0%、99.5%和99.3%。对SRBSDV-HuNDCS10及部分Fijiviruses病毒对应片段在5＇URT与3＇URT存在的保守序列和互补序列进行了归纳,对其ORF编码的氨基酸序列进行了motif查找,得到该属（Fijiviruses）氨基酸序列的10个保守区段。此外,进行了糖基化位点、磷酸化位点及B细胞抗原表位预测,发现了3个可能的N端豆蔻酰基化位点,可能与病毒的侵染机制有关。
南方水稻黑条矮缩病毒、S10片段、基因组序列分析
31
S435.111.4(病虫害及其防治)
公益性行业农业科研专项201003031;湖南省科技厅项目2010NK3021共同资助 诚挚感谢湖南省常德市鼎城区植保站送检的疑似感染SRBSDV的水稻材料
2012-07-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
160-166
