利用cvTree方法构建及分析tRNA序列的亲缘关系进化网络
本文利用cvTree和复杂网络理论相结合的方法,构建了3420条tRNA序列亲缘关系进化网络。计算了相关网络的平均度、平均聚类系数和平均最短路径随进化距离Dis变化的关系。同时还分析和讨论了tRNA序列之间的亲缘关系及其进化机制,观察到一个与其它方法不同的结果:随着亲缘距离Dis的增加,网络的度分布先是从power-1aw分布转变为Gussian分布,然后又从Gussian分布转变为反power-1aw分布。本研究结果说明由cvTree方法和复杂网络理论相结合的方法研究tRNA基因序列的进化的结果也许更加符合其进化历程。
tRNA序列、cvTree方法、复杂网络
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Q2-0
本研究南广西自然科学基金项目科自0728003;国家重点基础研究发展计划项目2006CB705500;国家自然科学基金资助项门10865001;广西研究生计划创新项目1059309030771共同资助致谢在论文完成过程中,薛郁老师在数据处理、文章格式以及图形处理等给予很多帮助,特此感谢
2012-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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371-378