斜带石斑鱼MyD88基因的克隆与表达

摘要：

本研究运用RACE-PCR技术获得斜带石斑鱼（Epinephelus coioides）髓样分化因子88（myeloid differentiation factor 88,MyD88）基因,并对该基因进行生物信息学和表达模式分析。研究结果表明1795bp的cDNA全长序列,包括ORF 870 bp、5＇UTR 243 bp和3＇UTR 682 bp,3＇UTR存在1个多聚腺苷酸加尾信号（AATAAA）和两个mRNA不稳定基序（ATTTA）。SMART软件预测该蛋白N端和C端分别存在死亡结构域和TIR结构域（Toll/IL-1 receptor homology domain,TIR）;与其它脊椎动物MyD88的序列同一性达57.1%～78.7%;用NJ法构建的系统进化树中,斜带石斑鱼MyD88和其它已报导的鱼类MyD88聚为一枝。qPCR检测结果显示MyD88基因mRNA主要表达于肝脏、脾脏、头肾和胸腺等组织。本研究为进一步探讨MyD88在斜带石斑鱼TLR信号传导中的作用奠定基础。

关键词：斜带石斑鱼、表达、髓样分化因子88(MyD88)

所属期刊栏目：30

分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家自然科学基金委员会;广东省人民政府自然科学联基金U0631010

在线出版日期：2012-04-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：288-295