基于伪氨基酸和支持向量机的蛋白质亚细胞定位预测

摘要：

用电子-离子伪势能(EIIP)对蛋白质序列数字化,经离散傅立叶变换(DFT)后,取5个最高幅值对应的频率和20种氨基酸在序列中所占的百分比组成伪氨基酸.用支持向量机(SVM)方法得到分类的模型,并用几个标准的测试方法测试模型的性能.自身一致性测试和Jackknife测试均取得高的预测准确率,独立数据集测试的准确率超过80%.和之前报道的方法相比,本方法具有较高的预测准确率.

关键词：生物信息、亚细胞定位、支持向量机、伪氨基酸、电子-离子伪势能

所属期刊栏目：25

分类号：Q617;TB114(理论生物物理学)

在线出版日期：2007-01-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：349-352,374