大规模板栗疫病菌cDNA文库的特征和冗余序列的排除

摘要：

低毒病毒/板栗疫病菌是一个研究病毒宿主相互作用的优良的实验系统.为了更好的了解病毒与宿主相互作用的机制,我们建立了一个野生型无病毒板栗疫病菌菌株EP155和受低毒病毒感染的菌株EP713的cDNA混和文库,以进行表达序列标签(EST)测定.对543个克隆的外源片段的分析表明,该文库克隆中含外源片段的比例为89.8%;通过小规模测序,发现空质粒与小片段克隆占测序总数的10.1%;表达丰度最高的4个克隆出现次数的总和占测序总数的9.6%.通过设计引物进行PCR和原位杂交,对cDNA文库2万多个克隆进行了筛选,共筛除了占总数19.7%的空质粒与小克隆和5.5%的高丰度克隆,为高效率的大规模EST测序准备了条件.

关键词：低毒病毒/板栗疫病菌、cDNA文库、高丰度克隆、原位杂交

所属期刊栏目：24

分类号：Q781(基因工程（遗传工程）)

资助基金：新材料领域项目2004AA223100;教育部高校骨干教师资助计划桂自科0229001;广西自然科学基金2000201;广西自然科学基金桂自科0229001

在线出版日期：2005-12-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：275-282