不同光色条件下京海黄鸡垂体转录组功能分析

摘要：

[目的]对不同光色条件下京海黄鸡垂体进行转录组测序分析,了解不同光色条件下京海黄鸡垂体的表达谱,旨在筛选出红光影响京海黄鸡生殖激素合成的关键基因,为提高种鸡产蛋性能提供理论基础.[方法]红光组京海黄鸡产蛋量(90.61枚)显著高于白光组(87.44枚)(P<0.05).选取红光和白光条件下京海黄鸡各3只,采集其垂体进行高通量测序,利用HISAT和DESeq等方法获得差异表达基因(DEGs)进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析.[结果]通过高通量测序获得4892794884～4980565639条Raw reads,比对到参考基因组的read比对率在92.00%以上,GC含量为48.54%～49.11%.将红光和白光条件下京海黄鸡的垂体进行比较,共获得155个DEGs,其中红光组与白光组(RP vs WP)相比,有90个基因表达上调和65个基因表达下调.对DEGs进行GO功能注释分析,主要在生物调控、细胞过程、细胞、细胞组分、连接和催化活性功能等重要生物途径.KEGG信号通路分析结果显示,DEGs主要富集在细胞因子—细胞因子受体相互作用、类固醇激素的生物合成通路、视黄醇的新陈代谢、花生四烯酸代谢、神经活性配体—受体相互作用等信号通路,这些通路中的促性腺激素释放激素基因(GNRH1)、分泌型磷蛋白1基因(SPP1)、信号转导蛋白1基因(SMAD1)、骨形态形成蛋白拮抗蛋白2抗体基因(GREM2)和表皮调节素基因(EREG)等表达可能受光色的影响,从而影响种鸡的产蛋性能.实时荧光定量PCR(qRT-PCR)结果证明了转录组测序结果准确可靠.[结论]与白光相比,红光能显著提高京海黄鸡的产蛋量.筛选获得的GNRH1、SPP1、SMAD1、GREM2和EREG等基因可能在光色调控京海黄鸡产蛋性能中发挥重要作用,可作为种鸡垂体组织调控其产蛋性能分子机制研究的关键基因.

关键词：光色、京海黄鸡、转录组、垂体

所属期刊栏目：54

分类号：S831.4(家禽)

在线出版日期：2023-08-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：797-805