黄鳝nanos3基因克隆鉴定及其组织表达分析

摘要：

[目的]明确nanos3基因在黄鳝卵巢发育和维持过程中的重要作用,为黄鳝PGCs可视化分子标记、生殖细胞移植及性腺发育分化机制研究打下基础.[方法]通过RACE克隆黄鳝nanos3基因cDNA序列,运用ProtParam、SOM-PA、SWISS-MODEL、SignalP、TMHMM及NetPhos等在线软件进行Nanos3蛋白生物信息学分析;采用实时荧光定量PCR检测nanos3基因在黄鳝不同组织中的表达情况,并以冰冻切片荧光原位杂交进行性腺组织定位.[结果]黄鳝na-nos3基因cDNA序列全长1289 bp,包括147 bp的5'非编码区(5'-UTR)、531 bp的开放阅读框(ORF)及611 bp的3'非编码区(3'-UTR),共编码176个氨基酸残基.黄鳝Nanos3蛋白分子量为19.61 kD,理论等电点(pI)为9.07,为碱性蛋白;在黄鳝Nanos3氨基酸序列第108～162位处存在2个锌指基序"CCHC"结构域,无信号肽和跨膜结构域;蛋白二级结构以无规则卷曲的占比最高(64.20％),其次是α-螺旋(占24.43％),延伸链、β-转角的占比分别为6.82％和4.55％.黄鳝与大刺鳅、射水鱼、斑马鱼等鱼类的Nanos3氨基酸序列相似性分别为67.5％、57.2％和50.3％,与中国林蛙、粗皮蛙等两栖类动物的相似性分别为39.3％和30.3％,与人类、小鼠等哺乳类动物的相似性分别为33.3％和30.9％.nanos3基因在黄鳝肌肉中不表达,在精巢、肾脏、脾脏、脑、肝脏、肠道、心脏和血液中的相对表达量较低,在卵巢中的相对表达量最高,极显著高于在其他组织中的相对表达量(P<0.01),呈明显的组织特异性表达模式;冰冻切片荧光原位杂交分析结果显示,黄鳝nanos3基因仅在生殖细胞中表达,支持细胞中未见表达.[结论]黄鳝nanos3基因进化相对保守,主要在卵巢的生殖细胞中表达,且以细胞质中的表达为主,与核遗传信息的传递相关,是黄鳝性腺发育及分化相关的功能基因.

关键词：黄鳝、nanos3基因、克隆、生物信息学、组织表达特征、荧光原位杂交

所属期刊栏目：53

分类号：S966.4(水产养殖技术)

资助基金：国家自然科学基金;江西省科学计划重点研发项目;江西省教育厅科技计划项目;江西省教育厅科技计划项目

在线出版日期：2022-11-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2321-2330